Наступившие в начале 90-х гг. экономические реформы нанесли тяжелый удар по предприятию, доля военной продукции в общем объеме производства которого достигала 95 %. Количество заказов стало стремительно сокращаться. На БАЗе попытались переломить ситуацию, адаптируя серийно выпускаемые изделия для гражданских целей и осваивая производство сугубо гражданской продукции. Сделать это оказалось непросто.

Проект, предполагавший выпуск 1,5-тонных цельнометаллических развозных фургонов семейства БАЗ-3783, считался очень перспективным. Полукапотная компоновка машины означала рациональное использование внутреннего пространства, трехместную кабину отделили от грузового отсека стальной перегородкой с окном. Грузовые операции облегчали малая погрузочная высота и двери — широкая сдвижная с правой стороны и задние распашные. Бензиновый мотор мощностью 92 л. с. разгонял фургон до 100 км/ч. Работа над машиной шла мучительно. Не хватало средств для закупки необходимого технологического оборудования, а детали и узлы, выпускаемые с использованием собственного универсального станочного парка, делали себестоимость автомобиля слишком высокой. После того как Горьковский автозавод наладил в конце 1995 г. крупномасштабное производство более дешевых панельных фургонов семейства ГАЗ-2705, работы по БАЗовскому автомобилю малой грузоподъемности окончательно прекратились. В общей сложности было изготовлено менее сотни экземпляров БАЗ-3783.
Далеко не все благополучно складывалось и с конверсией армейских вездеходов. Полноприводные машины были узко специализированными (под конкретный образец вооружения) и носили ярко выраженный индивидуальный характер. Они создавались для работы в экстремальных условиях и только с полной нагрузкой. Анализируя сложившуюся ситуацию, специалисты завода пришли к выводу, что амфибии можно с успехом использовать в районах стихийных бедствий, например во время наводнения. Самой подходящей для этого оказалась модель БАЗ-5921. После демонтажа ракетного комплекса получили достаточно просторную платформу. На ней свободно размещались автомобили типа микроавтобуса. Транспортная техника в грузовой отсек амфибии въезжала своим ходом по специальным аппарелям. Помимо этого, можно было перевозить людей и различные грузы массой до 7,5 т. Для спасателей изготовили партию конверсионных БАЗ-5921. Существовал и пожарный вариант этой машины.
Для выполнения универсальных задач оказались приспособлены бортовые грузовики БАЗ-69506 и БАЗ-69508, которые перевозят до 12 т груза, или шасси БАЗ-69507 под монтаж спецнадстроек грузоподъемностью 14 т. Вместо двух двигателей устанавливается один производства Ярославского моторного завода (ЯМЗ). Это могут быть модели 238Р мощностью 300 л. с. или 310-сильная 238БЛ. Шасси БАЗ-69507 использовалось в качестве транспортной базы для нефтепромыслового оборудования. БАЗ-69507 мог легко превращаться в топливозаправщик, пожарный автомобиль и т. д. Обновленный образец БАЗ-695071 отличался стальной кабиной, установленной вместо стеклопластиковой, а также усовершенствованными узлами и агрегатами.